David Baker、宋乐等联手创办GenBio AI: 虚拟细胞只是开始,数字有机体才是终局
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Source: MIT科技评论中文Publish time unverified
疾病的发生往往牵动多个生物层次。DNA 突变可能影响 RNA 转录和蛋白质合成,继而改变细胞、组织和器官,最终表现为患者的症状。 现有的 AI 模型能够解决这个链条中的部分问题:AlphaFold 可以预测蛋白质结构,基因组基础模型能够学习 DNA 中的规律,近年来快速升温的“虚拟细胞”则试图预测药物扰动之后,一个细胞会发生怎样的变化。 但这些模型大多仍然停留在某一个生命尺度。最近,GenBio AI 在 Nature Medicine 发文,公布了一项更有野心的构想:能不能把分子、细胞、组织、器官乃至人体不同层面的 AI 模型连接起来,在计算机中模拟一个生命系统?也就是利用AI 建立一个能够模拟生命运行的“数字有机体”(AI-Driven Digital Organism,AIDO)。论文还试图回答一个更具体的问题,这样一个跨尺度的数字生物体,究竟应该怎样一步步造出来? AIDO 本身并不新鲜,GenBio 自 2024 年以来一直在开发这一理念,并发布了覆盖 DNA、RNA、蛋白质、蛋白质结构,细胞和组织等方向的六类初始模型。“这篇论文更聚焦 AIDO 的整体构建思路,以及其在疾病…